自民國100年起，腦中風中心結合急診，提供24小時血栓溶解劑治療(俗稱通血路)、緊急腦中風手術顱內減壓治療、急性神經加護照顧及延續性腦中風復健治療，團隊成員包括神經內科醫師、神經外科醫師、復健科醫師、專科護理師、腦中風個管師、社工師、出院準備護理師等，提供完整腦中風治療指引諮詢、個案管理追蹤、或者社會福利資源協助申請、結合縣府社福機構聯繫及通報和出院後照護衛教支持服務。

民國102年起，本院腦中風中心設有全新與醫學中心同等級『手術導航系統』、『術中神經監測系統』，利用光學導航儀器進行精密顱內血管病灶手術，經由3D模擬畫面提供外科醫師掌握顱內病灶確切解剖位置，畫刀位置精確，手術傷口因而變小，患者得以更快恢復健康。

腦中風中心更於民國102年主動申請增加腦中風急性後期照護病房，讓符合條件的腦中風患者能在黃金復健期接受以病人為中心，延續性6到12週密集職能、物理、語言復健治療，以期降低殘障程度，提升生活品質。

於109年引進「RAPID」快速電腦斷層判斷系統，接軌國際AI人工智慧醫療，利用科技讓醫師能快速判斷大血管腦梗塞，提供即時、精確的判讀，適當的治療，可大幅減少患者失能殘障。